El Programa de Desarrollo Logístico administra un conjunto amplio de proyectos e iniciativas temas de planificación, gestión e institucionalidad en logística y transporte de carga. Estos abordan los modos ferroviario, marítmo, portuario y camiones, y en el ámbito de procesos logísticos destacan aquellos relativos a información y sistemas de coordinación. Algunos de los proyectos emblemáticos se describen a continuación: